1、利潤分配不均，養(yǎng)殖戶利益得不到保護，隨著勞動力成本的提升，廣大農民寧可出去打工也不從事養(yǎng)殖。而飼料經銷商、獸藥經銷商們依靠掌握一定的資源與飼料廠和食品廠討價還價謀求個人利益，成為行業(yè)中最大的贏家。肉食品渠道更是如此，造成真正從事實業(yè)工作養(yǎng)殖戶、飼料廠、食品廠卻得不到應該得到的利益，服務商卻是吃的臉大脖子粗，特別是廣大養(yǎng)殖戶的利益根本得不到應有的回報。
2、肉食品藥殘超標，出口受阻，國內宰殺廠低價惡性競爭。無論國內市場還是國際市場對中國肉食品均抱著不信任的態(tài)度，致使中國肉食品行業(yè)只能從事代工或低價競爭，陷入低價低效的惡性循環(huán)。
3、國家為了平抑物價和隨著WTO協議的逐步生效，肉食品進口激增。因為消費習慣不同國外進口食品價格偏低，對國內宰殺行業(yè)造成巨大沖擊。特別是國家2008年對養(yǎng)豬的補貼造成一窩蜂的母豬增欄，存欄量過大，供求關系失衡，豬肉產品價格一落千丈，連帶其他肉食品價格一蹶不振。
4、廣大散養(yǎng)戶養(yǎng)殖觀念陳舊不能接受新的管理理念，養(yǎng)殖水平參差不齊。隨著疾病的蔓延和爆發(fā)頻率的提高，特別最近的禽流感，造成肉雞養(yǎng)殖大面積萎縮，更加劇了飼料廠與食品廠的產能壓力，造成飼料企業(yè)與肉食品依靠價格惡性競爭。
5、養(yǎng)殖人員知識水平普遍偏低，中國自古雖然重農輕商，但是建國以后國家政策對農業(yè)傷害太大，極大的打擊了農業(yè)的積極性。農村優(yōu)秀的人才絕大部分進入工業(yè)與行政事業(yè)系統(tǒng)。大部分養(yǎng)殖戶基本上是不愿背井離鄉(xiāng)打工，土地收入又極為可憐的情況下，被逼從事養(yǎng)殖行業(yè)。養(yǎng)殖從業(yè)人員知識水平低，而且由于中國養(yǎng)殖行業(yè)發(fā)展時間很短，缺乏高級養(yǎng)殖技術指導人員，大部分屬于養(yǎng)殖戶自己摸索養(yǎng)殖經驗，許多想當然的理論推斷本身就是建立在一個虛假的錯誤基礎上面。
養(yǎng)殖理論上絕大部分采取拿來主義，借鑒西方養(yǎng)殖經驗，但是由于氣候、環(huán)境、從業(yè)人員素質等等原因造成許多管理理念與設備多有水土不符。前期蘇聯模式與近期西方模式均被證明不很適合我國國情，中國也是與二十世紀九十年代中期才剛剛開始建立自己的農業(yè)工程體系。所以造成了中國現在養(yǎng)殖發(fā)展水平相差很大，絕大部分以低效小散養(yǎng)戶為主，雞病疫情防治措施呆板落后，效果極差，整體養(yǎng)殖效益低下。
6、行情的無規(guī)則劇烈波動。由于養(yǎng)殖戶的群體基數過大，養(yǎng)殖理念不成熟，特別是國人的羊群效應特別明顯，跟風之風造成一窩蜂的上，一窩蜂的下，行情急劇的波動。國內部分不正規(guī)小飼料廠、小宰殺廠也得以生存的機會。要么養(yǎng)殖市場極度萎縮，造成配套企業(yè)行業(yè)性虧損，小廠們則偃旗息鼓等待時機，大廠苦苦的掙扎;要么養(yǎng)殖市場火爆異常，造成配套企業(yè)產能緊張，供求關系嚴重失衡，小廠趁機出海，對養(yǎng)殖戶利益進行打壓，造成養(yǎng)殖環(huán)節(jié)絕大部分虧損;養(yǎng)殖戶養(yǎng)殖熱情退潮，重新進入行情低迷期，如此周而復始的循環(huán)。市場這個無形的手在中國畜牧行業(yè)演繹的淋漓盡致，比中國的資本市場的波動有過之無不及，特別是養(yǎng)殖周期特別短的禽類市場。